用于包裝木箱的木材如果不妥善護理，也會出現木材變色的問題。防止木材變色的根本途徑在于：限制外因的產生和存在，除去或封閉木材內部變色成分，改變變色成分結構。

對于光變色、酸堿變色、鐵變色、酶變色等化學變色的預防，主要是用漆膜涂覆等手段阻斷外因，或用溶劑浸泡、化學處理等方法消除或改性木材內部變色成分。

對于光變色的預防有：包裝木箱隔斷紫外線，改變吸光成分結構，隔絕氧氣和捕捉游離基，破壞參與變色的物質結構，去除變色前驅物。

對于酶變色的預防，降低酶的活性和隔離氧，如進行酸堿處理調節pH值，通過煮沸、高頻加熱改變蛋白質性質，用抗氧化劑抑制酚酶活性，水存隔離氧。

對于生物變色的預防，包裝木箱改變或破壞適宜微生物或生物生存的溫度、濕度、pH值、氧氣及營養成分等環境因子，如噴水保存、塑料密封和化學藥劑處理。